Ikatan Keahlian di bawah Persatuan Dokter Gigi Indonesia (PDGI Provinsi Papua Barat Daya) sebagai berikut:

1. Ikatan Ahli Bedah Mulut dan Masilofasial (PABMI)
2. Ikatan Ortodontia Indonesia (IKORTI)
3. Ikatan Prostodontia Indonesia (IPROSI)
4. Ikatan Konservasi Gigi Indonesia (IKORGI)
5. Ikatan Penyakit Mulut Indonesia (ISPMI)
6. Ikatan Dokter Gigi Anak Indonesia (IDGAI)
7. Ikatan Periodontologi Indonesia (IPERI)
8. Ikatan Radiologi Kedokteran Indonesia (IKARGI)
9. Ikatan Odontologi Forensik Indonesia (IOFI)
10. Ikatan Spesialisasi Patologi Mulut dan Maksilofasial Indonesia (ISPaMMI)